また、亘理先生は、その生涯を通じて、おびただしい数の植物写真を撮影された。その写真は、植物学者として植物の形態的特徴を鋭くとらえたもので、植物学的に重要な情報を多く含んでいる貴重なものである。
また、植物そのものだけでなく、農作物としての植物の栽培のようすや、藁葺き屋根の上に補強のために植えられた植物（草棟、芝棟）なども多く撮影されている。これらは、現在では見られなくなったものも多く、日本における植物の栽培の歴史を示すだけでなく、民俗植物学、建築史などのうえからも大変興味深い。
これらの写真の一部が、先生が1993年に他界された後、当館に寄贈された。
これらの写真は、多くの植物図鑑や百科事典などに使用されたが、亘理先生ご自身の著作としては、写真集「植物（全６巻）」（第一法規，1961-1964）のほか、「芝棟」（八坂書房，1991）等がある。